MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 5602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013124	GAGG	2	8	215172	215179	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013124	CGT	2	6	215180	215185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_013124	CGT	3	9	215243	215251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013124	GCC	2	6	215289	215294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_013124	TGA	2	6	215324	215329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013124	CCT	2	6	215592	215597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_013124	CCA	2	6	215625	215630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_013124	TCC	2	6	215640	215645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_013124	GCT	2	6	215676	215681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_013124	ACG	2	6	215690	215695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013124	TCCGA	2	10	215730	215739	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
512	NC_013124	ATCG	2	8	215748	215755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_013124	GGA	2	6	215810	215815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013124	AGG	2	6	221353	221358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013124	GAA	2	6	221396	221401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013124	AGG	2	6	221413	221418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013124	CG	3	6	224636	224641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_013124	AG	3	6	224674	224679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013124	CGGC	2	8	224694	224701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_013124	GCG	2	6	224710	224715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_013124	CT	3	6	224718	224723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_013124	GCCA	2	8	224768	224775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_013124	CG	3	6	224782	224787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_013124	TCG	2	6	224788	224793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_013124	GTG	2	6	224854	224859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013124	GAGC	2	8	224879	224886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
527	NC_013124	GTC	2	6	224891	224896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_013124	GCT	2	6	224915	224920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013124	CGA	2	6	224967	224972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_013124	CTC	2	6	224979	224984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_013124	GAT	2	6	224991	224996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013124	TGG	2	6	225026	225031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013124	GGA	2	6	225069	225074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013124	TGAC	2	8	225078	225085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_013124	GAAG	2	8	225088	225095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013124	GC	3	6	225828	225833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_013124	GCG	2	6	228698	228703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013124	GCT	2	6	228706	228711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_013124	CGA	2	6	228717	228722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_013124	CGA	2	6	229484	229489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013124	CGT	2	6	231351	231356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013124	CGA	2	6	231357	231362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013124	CTTAC	2	10	232840	232849	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
544	NC_013124	GGCT	2	8	232850	232857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_013124	GAG	2	6	235107	235112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013124	GTC	2	6	235125	235130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_013124	GTC	2	6	235157	235162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013124	CTG	2	6	235165	235170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_013124	GAC	2	6	235188	235193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_013124	TGG	2	6	235218	235223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013124	GCC	2	6	235282	235287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_013124	GTCA	2	8	240039	240046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_013124	GC	3	6	240097	240102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_013124	GAT	2	6	240613	240618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013124	CA	3	6	242568	242573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_013124	CGA	2	6	242654	242659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013124	TGGA	2	8	242662	242669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013124	GTC	2	6	242683	242688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_013124	GAT	2	6	242716	242721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013124	GCG	2	6	242742	242747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_013124	G	6	6	242755	242760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013124	GT	3	6	242781	242786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013124	CCATG	2	10	242850	242859	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
564	NC_013124	TGTGG	2	10	242921	242930	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013124	CGC	2	6	242965	242970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_013124	CGG	2	6	242981	242986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013124	GGT	2	6	243039	243044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013124	CGT	2	6	243049	243054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_013124	CGAT	2	8	243065	243072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_013124	G	6	6	243081	243086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013124	GAG	2	6	243439	243444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013124	GCA	2	6	243924	243929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013124	AGG	2	6	243972	243977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013124	CG	3	6	243990	243995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_013124	TGGG	2	8	244008	244015	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013124	CCT	2	6	246052	246057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_013124	TCG	2	6	246093	246098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_013124	GGA	2	6	246185	246190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013124	CGT	2	6	247625	247630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_013124	CGA	2	6	247744	247749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_013124	CGA	2	6	249643	249648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_013124	CGT	2	6	249681	249686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013124	TGC	2	6	249763	249768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013124	GAG	2	6	249773	249778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013124	GAC	2	6	249830	249835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013124	GGC	2	6	249842	249847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_013124	GAA	2	6	253201	253206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013124	GAA	2	6	253252	253257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013124	CGG	2	6	253335	253340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_013124	GGA	2	6	253344	253349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013124	CTG	2	6	253355	253360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013124	CGT	2	6	253459	253464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013124	CGAGGC	2	12	253496	253507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_013124	GTCG	2	8	253576	253583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
595	NC_013124	GTC	2	6	253623	253628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_013124	GAG	2	6	253642	253647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013124	GGCC	2	8	253685	253692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_013124	TG	3	6	253740	253745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013124	AG	3	6	253772	253777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013124	TCG	2	6	257365	257370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013124	GC	3	6	259640	259645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_013124	GC	3	6	259653	259658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_013124	CT	3	6	261056	261061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_013124	TCGC	2	8	261066	261073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_013124	CCG	2	6	261117	261122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_013124	GC	3	6	261129	261134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_013124	GCC	2	6	261214	261219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_013124	CCA	2	6	261220	261225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_013124	GGC	2	6	261231	261236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_013124	GAC	2	6	261291	261296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_013124	CGA	2	6	262220	262225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013124	GTC	2	6	262234	262239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_013124	GC	3	6	262256	262261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_013124	TCG	2	6	262306	262311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013124	TCG	3	9	262325	262333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013124	GGC	2	6	262359	262364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013124	GAG	2	6	262386	262391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013124	CCG	2	6	263305	263310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_013124	CGA	2	6	263329	263334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013124	CGC	2	6	263336	263341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_013124	CG	3	6	267738	267743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_013124	GGGC	2	8	267753	267760	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
623	NC_013124	GAA	2	6	267777	267782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013124	GGA	2	6	267783	267788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013124	AGG	2	6	268194	268199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013124	GC	3	6	268938	268943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_013124	CTCG	2	8	268963	268970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
628	NC_013124	CGT	3	9	269010	269018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013124	AGT	2	6	269059	269064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013124	GTG	2	6	269065	269070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013124	CG	3	6	269146	269151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_013124	CAC	2	6	269175	269180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_013124	GAG	2	6	269204	269209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013124	CGACA	2	10	270267	270276	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
635	NC_013124	CGAGA	2	10	270293	270302	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
636	NC_013124	GC	3	6	271365	271370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_013124	GTTC	2	8	271386	271393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_013124	GCT	2	6	271422	271427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013124	CGA	3	9	271435	271443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013124	CGG	2	6	271455	271460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_013124	TGC	2	6	271461	271466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_013124	ACGA	2	8	271468	271475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
643	NC_013124	GCG	2	6	271494	271499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_013124	CGT	2	6	271509	271514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_013124	TCC	2	6	272231	272236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
646	NC_013124	GCG	2	6	272295	272300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_013124	CGG	2	6	272313	272318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_013124	TCG	2	6	272332	272337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_013124	CTCGA	2	10	272347	272356	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
650	NC_013124	CGTC	2	8	272384	272391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
651	NC_013124	GTC	2	6	272410	272415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_013124	TGC	2	6	272902	272907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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654	NC_013124	CT	3	6	275817	275822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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656	NC_013124	GGC	2	6	275860	275865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_013124	CGA	2	6	281275	281280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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659	NC_013124	GAGC	2	8	281309	281316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
660	NC_013124	CTC	2	6	282318	282323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
661	NC_013124	GC	3	6	282340	282345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
662	NC_013124	TCG	2	6	284115	284120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_013124	TGG	2	6	284165	284170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
664	NC_013124	CGC	2	6	284173	284178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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670	NC_013124	GC	3	6	286214	286219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
671	NC_013124	GTC	2	6	286272	286277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
672	NC_013124	ACG	2	6	286343	286348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_013124	AGC	2	6	286368	286373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_013124	TCG	3	9	289756	289764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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683	NC_013124	CGGCGC	2	12	291015	291026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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686	NC_013124	CG	3	6	291098	291103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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732	NC_013124	TCG	3	9	314811	314819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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753	NC_013124	CGC	2	6	315644	315649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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756	NC_013124	CG	3	6	316898	316903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
757	NC_013124	GAG	2	6	318444	318449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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759	NC_013124	CGT	2	6	326158	326163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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762	NC_013124	TCC	2	6	329599	329604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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767	NC_013124	TG	3	6	330360	330365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
768	NC_013124	AGGA	2	8	336900	336907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
769	NC_013124	CCT	2	6	338353	338358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
770	NC_013124	CGA	2	6	338372	338377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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